Curriculum vitae

Prof. RNDr. Josef Komenda, CSc., DSc.

Afiliace

Mikrobiologický ústav AV ČR, Centrum Algatech, Novohradská 237 - Opatovický mlýn, 379 81 Třeboň,  tel.+420-384-340431, fax +420-384-340415, e-mail komenda@alga.cz

Pozice

Vedoucí vědecký pracovník, vedoucí Laboratoře fotosyntézy

ORCID: 0000-0003-4588-0382

Přehled zaměstnání

• březen 1993 – únor 1994, výzkumný asistent, skupina J. Barbera, Imperial College, Londýn
• březen 1994 – prosinec 2003, vědecký pracovník, Mikrobiologický ústav AV ČR, Třeboň
• leden 2004 – nyní, vedoucí vědecký pracovník, vedoucí laboratoře, Mikrobiologický ústav AV ČR, Třeboň
• leden 2005 - 2010, docent, Jihočeská univerzita, České Budějovice
• leden 2010 - nyní, profesor, Jihočeská univerzita, České Budějovice (částečný úvazek)

Pobyty v zahraničí

• leden 2001 - prosinec 2007, celkem 3 měsíce, LMU Mnichov
• červenec 1997, jeden měsíc v Plant Molecular Biology Laboratory, Beltsville, USA
• listopad 1991 - prosinec 1997, celkem 3 měsíce, Instituto di Radiobiochim Ecofisiol Vegetali, CNR, Řím
• březen 1995, 3 měsíce FEBS Fellowship, Imperial College, Londýn
• březen 1993 - únor 1994, jeden rok, Imperial College, Londýn
• týdenní pobyty v Biological Research Centre, Szeged (10x) a NanyangTechnological University, Singapur (1x)

Spolupracovníci

Peter Nixon a James Murray (Imperial College, Londýn); Neil Hunter (Sheffield University, Sheffield); Tomáš Polívka (Jihočeská univerzita, České Budějovice); Roman Kouřil, (Univerzita Olomouc); Annegret Wilde (Univerzita ve Freiburgu); Dario Leister (LMU Mnichov), Leonid Sazanov (Institute of Science and Technology Austria, Vídeň), Andreas Naschberger (King Abdullah University of Science and Technology, Saudská Arábie)

Mentoring a supervize studentů

2 magisterští studenti a 6 doktorandů úspěšně ukončilo studium, 2 doktorandi v současné době pracují na disertační práci

Grantová podpora - ČR

• 2024 - 2026, Grantová agentura ČR, 24-10227S, hlavní řešitel
• 2019 - 2023, Grantová agentura ČR, EXPRO 19-29225X, hlavní řešitel 
• 2012 - 2018, Grantová agentura ČR , 501/12/G055, spoluřešitel
• 2011 - 2015, Grantová agentura ČR, 501/11/0377, hlavní řešitel  
• 2008 - 2011, Akademie věd ČR, IAA400200801, hlavní řešitel 
• 2006 - 2008,  Akademie věd ČR, 206/06/0322, hlavní řešitel 
• 2004 - 2006, Grantová agentura ČR, 203/04/0800, hlavní řešitel 
• 2000 - 2004, Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (LN00A141), spoluřešitel
• 2000 - 2002, Grantová agentura ČR, 203/00/1257, hlavní řešitel 
• 1998 - 2000, Grantová agentura ČR, 204/98/0418, hlavní řešitel 
• 1995 - 1997, Grantová agentura ČR, 204/95/1043, hlavní řešitel

Mezinárodní projekty

•  2020 - 2026, H2020, ERC, 854126 PhotoRedesign, hlavní řešitel

Přednášky a konferenční příspěvky (2020-2024, * pozvané)

• 17th International Symposium on Phototrophic Prokaryotes (ISPP), Liverpool, 2022
• 18th Congress on Photosynthesis Research, Dunedin New Zealand, 2022
• *8th European Workshop on the Molecular Biology of Cyanobacteria, Porto, 2020

Ceny, ocenění

• 2008, 2010, 2012; 2013, 2016, 2018, 2019, 2020, 2024 - Cena ředitele za nejlepší vědeckou publikaci Mikrobiologického ústavu AV ČR
• 2016 - Cena Akademie věd ČR za vynikající výsledky v oboru „Biogeneze a ochrana fotosystému II“ (vedoucí týmu)
• 2002 - Wichterleho cena pro vynikající mladé badatele Akademie věd ČR

5 nejlepších publikací v letech 2020 - 2024

Komenda, J., Sobotka, R,, Nixon, P.J.* The biogenesis and maintenance of photosystem II: recent advances and current challenges. Plant Cell. 2024. doi: 10.1093/plcell/koae082

Zhao, Z., Vercellino, I., Knoppová, J., Sobotka, R., Murray, J.W., Nixon, P.J.*, Sazanov, L.A.*, Komenda, J.* The Ycf48 accessory factor occupies the site of the oxygen-evolving manganese cluster during photosystem II biogenesis. Nature Commun 14,:4681, 2023; https://doi.org/10.1038/s41467-023-40388-6

Krynická, V., Skotnicová, P., Jackson, P.J., Barnett, S., Yu, J., Wysocka, A., Kaňa, R., Dickman, M.J., Nixon, P.J., Hunter, C.N., Komenda J. FtsH4 protease controls biogenesis of PSII complex by dual regulation of Hlips level: Plant Commun 4, 100502, 2023. https://doi.org/10.1016/j.xplc.2022.100502

Knoppová, J., Sobotka, R., Yu, J., Bečková, M., Pilný, J., Trinugroho, J.P.,  Csefalvay, L., Bína, D., Nixon, P.J., Komenda, J.* Assembly of D1/D2  reaction center complexes of photosystem II: stepwise binding of of pigments and a network of auxiliary proteins.  Plant Physiol 189, 790–804, 2022; https://doi.org/10.1093/plphys/kiac045

Trinugroho, J.P., Bečková, M., Shao, S., Yu, J., Zhao, Z., Murray, J.W., Sobotka, R., Komenda, J., Nixon, P.J.* Chlorophyll f synthesis by a super-roque photosystem II complex. Nature Plants 6, 238-244, 2020. 10.1038/s41477-020-0616-4