Curriculum vitae

Paulina Duhita Anindita, D.V.M., Ph.D.

ORCID: 0000-0001-9885-5813

Afiliace

Mikrobiologický ústav AV ČR, Centrum Algatech, Novohradská 237 - Opatovický mlýn, 379 81 Třeboň, CZ

Pozice

Vědecký asistent

Vzdělání a akademická kvalifikace

• 2017, Ph.D. v Molekulární virologii, Graduate School of Veterinary Medicine, Hokkaido University, Sapporo, Japonsko
• 2012,  D.V.M., Fakulta veterinárního lékařství, Univerzita Gadjah Mada, Yogyakarta, Indonésie

Přehled zaměstnání

• od r. 2024, Vědecký asistent, Centrum Algatech, Mikrobiologický ústav AV ČR
• 2022 - 2024, Výzkumný pracovník, LKC-Medicine, Nanyang Technological University, Singapur
• 2019 - 2022, Postdoktorand, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita, CZ
• 2017 - 2018, Postdoktorand, Výzkumné centrum pro kontrolu zoonóz, Univerzita Hokkaido, Sapporo, Japonsko

Stáže, kurzy, workshopy a certifikace

• 2024, Agile Project Management, Google Project Management Course, online
• 2019, Praktický kurz EMBO: Praktická integrativní strukturální biologie, EMBL Hamburg, Německo
• 2019, Workshop EMBO: Nástroje pro strukturní biologii membránových proteinů, EMBL Hamburg, Německo
• 2017, Certifikace odborníka na kontrolu zoonóz, Univerzita Hokkaido, Sapporo, Japonsko
• 2016, Stáž, Laboratoř Prof. Denise Shieldse, UCD Conway Institute of Biomolecular and Biomedical Research, University College Dublin, Irsko (1 měsíční pobyt)

Výzkumný zájem a současná výzkumná práce

• Regulace počtu kopií plazmidu sinic
• Strukturní a funkční studium virových proteinů
• Vývoj antivirotik směrem k RNA virům
• Molekulární epidemiologie nových virů

Mentoring a supervize studentů

• Spoluškolitelka 1 Bc. a 1 MSc. studenta (obě práce dokončené), Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita, CZ
• Recenzentka 1 Bc. práce, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita, CZ
• Mentorka 1 stážisty a 1 externího studenta, Nanyang Technological University, Singapur

Vybrané konferenční přednášky

• 2019, Midwest AViDD Center - 3rd Workshop, Minnesota, USA - „Aktualizace inhibitorů proteázy ZIKV“
• 2021, 25. Kongres IUCr, Praha, Česká republika - „Mechanismus RNA-stimulované ATP hydrolýzy helikázou NS3 viru klíšťové encefalitidy (TBEV)“
• 2021, 26. Výroční kongres Českých a Slovenských společností pro biochemii a molekulární biologii, Česká republika - „Strukturální snímky ATPázového cyklu helikázy viru klíšťové encefalitidy“
• 2018, 3. Mezioborové sympozium Univerzity Hokkaido, Sapporo, Japonsko - „Silný in vitro účinek analogu ribavirinu proti viru vztekliny“

Vybrané postery

• 2019, 10. Mezinárodní sympózium o sestavování virů, Portugalsko - „Allosterická vazba mezi vazbou RNA a hydrolýzou ATP v helikáze viru klíšťové encefalitidy“
• 2017, 65. Výroční zasedání Japonské virologické společnosti, Osaka, Japonsko - „Antivirová aktivita sloučenin příbuzných ribavirinu proti viru vztekliny in vitro“
• 2014, 37. Výroční zasedání Společnosti molekulární biologie Japonska, Yokohama, Japonsko - „Fylogenetická analýza netopýřího koronaviru z kaloňů v Indonésii“

Publikační matrice

• Celkový počet výzkumných článků: 12 (6 prvních, 6 spoluautorů) • Celkový počet citací: 246 (Scopus), 341 (Google Scholar) • H-Index: 9 (Scopus), 10 (Google Scholar)

Vybrané publikace

1. Anindita, PD, Otsuka, Y., Lattmann, S., Ngo, K.H., Liew, C.W., Kang CB, Harris, R.S., Scampavia, L., Spicer, T.P., and Luo D. 2024. A high-throughput cell-based screening method for Zika virus protease inhibitor discovery. SLAS Discovery. DOI: 10.1016/j.slasd.2024.100164.
2. Anindita, PD, Halbeisen, M., Reha, D., Tuma, R., and Franta, Z. 2022. Mechanistic insight into the RNA stimulated-ATPase activity of tick-borne encephalitis virus helicase. J Biol Chem. DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102383.
3. Orba, Y, Hang'ombe, BM, Mweene, AS, Wada, Y, Anindita, PD, Phongphaew, W, Qiu, Y, Kajihara, M, Mori-Kajihara, A, Eto, Y, Sasaki, M, Hall, WW, Eshita, Y, Sawa, H. 2018. First isolation of West Nile virus in Zambia from mosquitoes. Transbound. Emerg. Dis. DOI: 10.1111/tbed.12888.
4. Anindita, PD, Sasaki, M, Okada, K, Ito, N, Sugiyama, M, Saito-Tarashima, N, Minakawa, N, Shuto, S, Otsuguro, S, Ichikawa, S, Matsuda, A, Maenaka, K, Orba, Y, and Sawa, H. 2018. Ribavirin-related compounds exert in vitro inhibitory effects toward rabies virus. Antiviral Res. DOI: 10.1016/j.antiviral.2018.03.011
5. Sasaki, M, Anindita, PD, Ito, N, Sugiyama, M, Carr, M, Fukuhara, H, Ose, T, Maenaka, K, Takada, A, Hall, WW, Orba, Y, Sawa, H. 2018. Heparan sulfate proteoglycans serve as an attachment factor for rabies virus entry and infection. J Infect Dis. DOI: 10.1093/infdis/jiy081.
6. Sasaki M, Orba Y, Anindita, PD, Ishii, A, Ueno, K, Hang’ombe, BM, Mweene, AS, Ito, K, Sawa, H. 2015. Distinct lineages of bufavirus in wild shrews and nonhuman primates. Emerg. Infect. Dis. DOI: 10.3201/eid2107.141969.