Surbhi Sharma

Surbhi Sharma má bakalářský a magisterský titul v oboru Botanika se specializací na Ekofyziologii rostlin. Poté, co získala zkušenosti v oblasti duševního vlastnictví (patenty) na CSIR-URDIP a CSIR-TKDL v Indii, se v roce 2023 vrátila na akademickou půdu, aby pokračovala v Ph.D. studiu. Pod vedením Venduly Krynické ve Skupině Josefa Komendy zkoumá různé úlohy membránových proteáz rodiny FtsH v modelové sinici Synechocystis sp. PCC 6803. Sinice kódují čtyři homology FtsH, které tvoří heteromerní (FtsH1/3 a FtsH2/3) a homomerní (FtsH4) komplexy. Přesná funkce a substrátová specifita těchto komplexů jsou stále z velké části neznámé. Surbhi se zaměřuje na různé funkce homologů FtsH s důrazem na jejich vliv na životaschopnosti buněk a buněčnou homeostázi. Věnuje se identifikaci substrátů FtsH proteáz, a za tímto účelem využívá mutantní kmeny, u kterých je proteolytická doména příslušné FtsH inaktivována bodovou mutací. Takto upravený protein pak může být izolován metodou afinitní chromatografie spolu s potenciálními proteinovými substráty. Nedávné výsledky naznačují možnou roli FtsH4 v regulaci mechanismu koncentrace anorganického uhlíku (CCM) prostřednictvím degradace regulačního faktoru SbtB. Surbhi také zkoumá roli homologu FtsH3 v regulaci syntézy chlorofylu pomocí identifikace enzymů zapojených do syntézy tetrapyrrolu jako možných substrátů pro FtsH3. Kromě toho pracuje na charakterizaci nově zkonstruovaných chimérických kmenů FtsH, ve kterých jsou různé domény FtsH1 exprimovány pod lokusem ftsH2. Předběžné výsledky ukazují, že pro subcelulární lokalizaci a funkci FtsH1 a FtsH2 v Synechocystis je klíčová transmembránová doména proteázy. Surbhina práce také přispěla k objasnění toho, jak proteázy FtsH řídí akumulaci proteinových faktorů zapojených do biogeneze fotosystému I (Konik et. al 2023).