Jméno: | Hronek Pavel, Bc. Laboratoř fotosyntézy Skupina Josefa Komendy |
---|---|
E-mail: | hronek(et)alga.cz |
Pracovní zařazení: | Odborný pracovník VaV |
Pavel Hronek
Pavel ukončil v roce 2023 bakalářské studium na Jihočeské univerzitě v Českých Budějovicích. Od téhož roku pracuje v Centru Algatech jako bioinformatik. Pod vedením Venduly Krynické se zaměřuje především na analýzu RNA-sekvenačních dat prostřednictvím R studia s cílem zjistit, jaké geny jsou up- a down-regulovány za různých podmínek. Tato analýza ukazuje, které geny jsou určitou změnou prostředí nejvíce ovlivněny a zda jsou součástí určitých genových klastrů se specifickou funkcí. Pavel také úzce spolupracuje s Tomaschem Jürgenem z Laboratoře anoxygenních fototrofů. Spolu s ním pracoval na vytvoření sítě genů a jejich klastrů na základě jejich interakčních úrovní pro několik organismů pomocí platformy Cytoscape, a v poslední době se zaměřuje na zpracování HiC dat pro Gemmatimonas a Dinoroseobacter shibae a jejich kontaktních map s cílem studia konformace chromozomů.