Vishma Pratap Sur

ORCID: 0000-0002-1175-7194

Výzkumný zájem

Vishmův výzkum se zaměřuje na purifikaci a charakterizaci přírodních produktů ve spojení s hodnocením jejich biologické aktivity jako antibakteriálních a protinádorových látek. To zahrnuje izolaci bioaktivních sloučenin z přírodních zdrojů a následné důkladné objasnění struktury s využitím pokročilých spektroskopických technik, jako je NMR, MS a rentgenová krystalografie. Tyto sloučeniny se pak hodnotí pomocí testů in vitro a in vivo, aby se určila jejich biologická účinnost jako terapeutických látek.
Kromě experimentálních přístupů Vishma využívá výpočetních metod ke zkoumání interakcí přírodních sloučenin se specifickými proteinovými cíli. To zahrnuje molekulární dokovací studie k předpovědi vazebné afinity, simulace molekulární dynamiky k pochopení stability a konformačních vlastností molekulární dynamiky komplexů protein-ligand a výpočty volné energie pro kvantifikaci vazebných sil. Tyto výpočetní techniky poskytují cenné poznatky o mechanismech působení a pomáhají při návrhování účinných inhibitorů s vysokou specificitou a účinností proti cílovým onemocněním.

Curriculum vitae

• May 2024 – present: Postdoktorand, Algatech, Mikrobiologický ústav AV ČR, Třeboň, ČR.
• February 2024 – March 2024: Vědecký pracovník, Sampling Human, Plzeň, ČR.
• July 2020 – January 2024: Postdoktorand, Biotechnologický ústav, BIOCEV, AV ČR, Vestec, ČR.
• November 2019: Stážista, Utah State University, Logan, USA.
• November 2017 – July 2020: Doktorský student, Oddělení chemie a biochemie, Mendelova universita v Brně, Brno, ČR.
• November 2017 – July 2020: Odborný pracovník, CEITEC-VUT, Brno, ČR.
• May 2017 – November 2017: Výzkumný pracovník, Indian Institute of Chemical Biology, Kolkata, Indie.
• December 2015 – March 2017: Projektový pracovník, Indian Institute of Chemical Biology, Kolkata, Indie.
• May 2015 – November 2015: Odborný pracovník, Presidency University, Kolkata, Indie.
• November 2014 – May 2015: Biotech Industrial Trainee at GCC Biotech-DBT Government of India, Kolkata, Indie.
• July 2012 – August 2014: MSc. v Biotechnologii, The University of Burdwan, Indie.
• July 2009 – May 2012: BSc. v Molekulární biologii a biotechnologii, Indie.

Granty a stipendia

• July 2023 – June 2024: Correlative Light and Electron Microscopy with Focused Ion BeamScanning Electron Microscopy for Comparative Ultrastructural Analysis of Midpiece and Mitochondria in Human Sperm Cells: A Novel Approach to unveil hidden aberration in Normospermic and Patients with burden of Testicular Germ Cell Tumour. Medical Imaging under Czech Bioimaging grant Program.
• January 2023 – December 2023: Two photon microscopy as a tool for analysis of the metabolic status of human sperm in physiological and pathological conditions. Medical Imaging under Czech Bioimaging grant program.
• January 2022 – December 2023: Post-Doctoral Support from Czech Academy of Sciences (Prospective human resources support program – postdoctoral students).
• November 2019 – February 2020: Visiting scholar grant for USA, Utah State University. 
• January 2019 – December 2019: IGA for PhD student, Mendel University.
• March 2017 – November 2017: Senior Research Fellow, CSIR, IICB.
• November 2014 – May 2015: DBT-BCIL scholarship for industrial training.

Top 5 publikací

1. Sur, V.P.; Simonik, O.; Novotna, M.; Mazumdar, A.; Liska, F.; Vimberg, V.; Komrskova, K. Dynamic study of small toxic hydrophobic proteins PepA1 and PepG1 of Staphylococcus aureus. International Journal of Biological Macromolecules 2022. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.07.192.
2. Sur, V.P., Mazumdar. A, Vimberg, V., Stefani. T, Androvic, L., Kracikova, L, Laga, R., Kamenik, Z., Komrskova, K. Specific Inhibition of VanZ-Mediated Resistance to Lipoglycopeptide Antibiotics, International Journal of Molecular Sciences 23(1) (2022) 97. https://doi.org/10.3390/ijms23010097.
3. Sur, V.P.; Mazumdar, A.; Ashrafi, A.; Mukherjee, A.; Milosavljevic, V.; Michalkova, H.; Kopel, P.; Richtera, L.; Moulick, A. A Novel Biocompatible Titanium–Gadolinium Quantum Dot as a Bacterial Detecting Agent with High Antibacterial Activity. Nanomaterials 2020, 10, 778. https://doi.org/10.3390/nano10040778.
4. Sur, V.P.; Mazumdar, A.; Kopel, P.; Mukherjee, S.; Vítek, P.; Michalkova, H.; Vaculovičová, M.; Moulick, A. A Novel Ruthenium Based Coordination Compound Against Pathogenic Bacteria. International Journal of Molecular Sciences 2020, 21, 2656. https://doi.org/10.3390/ijms21072656.
5. Sur, V.P.; Kominkova, M.; Buchtova, Z.; Dolezelikova, K.; Zitka, O.; Moulick, A. CdSe QD Biosynthesis inYeast Using Tryptone- Enriched Media and Their Conjugation with a Peptide Hecate for Bacterial Detection and Killing. Nanomaterials 2019, 9, 1463. https://doi.org/10.3390/nano9101463.